复合碱也有很明显的弊端，复合碱中的氢氧化钙为难溶物，如果污水呈酸性时，可以溶解于水中，当污水呈中性或碱性时，氢氧化钙将形成沉淀，因此使用复合碱产生的污泥要远远大于氢氧化钠，由于现在污泥的处理成本不断上涨，污泥量大，污泥处理成本自然就更高。因此，实际上复合碱的使用成本是否低于氢氧化钠还需要仔细核算。